蛋白及蛋白质组学研究
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代谢组学数据分析及多元统计分析与应用
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蛋白质的o-连接糖基化修饰是将寡糖连接到
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如何分析蛋白–蛋白相互作用:实验技术指南
蛋白–蛋白相互作用(Protein–Protein Interactions, PPI)构成了细胞内几乎所有生命活动的基础。从信号转导、转录调控、蛋白降解,到免疫应答和肿瘤发生,蛋白–蛋白相互作用调控着分子网络的稳定与动态变化。近年来,随着结构生物学、质谱技术和高
如何选择合适的富集策略进行酰基化肽段捕获?
蛋白质酰基化(Acylation)作为一种重要的翻译后修饰(PTM),在调控细胞信号转导、基因表达、代谢调节等过程中发挥着关键作用。常见的酰基化类型包括乙酰化(Acetylation)、丙酰化(Propionylation)、丁酰化(Butyrylation)等,它们广泛存在于组蛋白和非组蛋白上,参
基于质谱的蛋白质测序:原理与优势
在精准医学、生物制药、基础研究不断深化的当下,获取高质量的蛋白质序列信息已成为生命科学研究不可或缺的一环。蛋白质作为生物体功能执行的直接承担者,其一级结构(氨基酸序列)是理解蛋白功能、研究疾病机制、开发靶向药物的基础。随着质谱技术的飞跃式发展,基于质谱的蛋白质测序(Mass Spectrometry
如何选择合适的蛋白质测序技术?
蛋白质测序是研究蛋白质结构与功能的核心技术,广泛应用于靶点发现、机制解析、生物标志物筛选、抗体表征等生物医学研究和药物开发领域。然而,随着质谱技术和化学测序手段的不断发展,市面上可选的蛋白质测序技术越来越多,不同技术的适用场景、分辨率、成本和通量也有所差异。那么,面对众多测序方案,科研人员应如何科学
5款常用蛋白质序列比对工具推荐
引言:为什么蛋白质序列比对如此重要? 蛋白质的功能往往蕴含在其序列信息中。氨基酸序列中的保守区域、活性位点或修饰位点,都是功能预测的关键线索。通过与数据库中已知蛋白序列进行比对,我们可以:注释未知蛋白功能;发现同源蛋白或进化分支;识别结构域、结合位点或抗原表位;为蛋白结构预测、分子对接和药物筛选打基
De Novo测序常见问题解析
在蛋白质组学与抗体研究中,De Novo测序技术以其不依赖数据库、可还原完整蛋白序列的独特优势,成为科研人员和生物医药企业的重要工具。尤其在抗体序列解析、古蛋白重建、新型抗原发现等场景下,De Novo几乎是唯一可行的解决方案。然而,由于该技术涉及复杂的质谱数据解读与算法重建,许多科研人员在项目初期
下一代De Novo测序算法
De Novo测序,即从头推断肽段氨基酸序列,是蛋白质组学中识别未知蛋白、修饰肽段、抗体片段等的重要工具。相较于数据库搜索方法,De Novo测序不依赖参考数据库,适用于非模式物种、数据库不全、翻译后修饰、多变异样本等复杂场景。然而,传统的De Novo算法(如PEAKS、Novor、PepNovo
